2022年6月1日17时00分四川雅安芦山发生6.1级地震。灾情发生后，市卫生健康委快速反应，立即组织医疗救治和卫生防疫应急队伍赶赴芦山县、宝兴县。
6月1日23:00，疫情防控应急队伍分别到达宝兴县、芦山县。在了解目前灾情形势后，立即对宝兴县5个安置点、宝兴水厂、灵关水厂开展水质采样。由于宝兴县疾控中心实验室受灾情影响不能正常开展工作，水质样本连夜送至芦山县疾控中心进行检测。查看了安置点“五有五强化”工作的落实情况，即：有安全期饮水、有安全食品、有医疗防疫点、有垃圾桶、有厕所，强化疫情防控、强化安全饮水、强化食品安全、强化爱国卫生、强化督促指导。
同时，对新冠肺炎疫情防控工作进行了督导，要求落实进出安置点扫码亮码，戴口罩等措施，促进灾区多病同防，避免顾此失彼。
6月2日市疫情防控应急队伍同省疾控专家一并再次对芦山县太平中学、大河村委会、钟灵小学、钟灵新村、红军广场五个居民安置点开展了灾后健康教育、科学卫生消杀、病媒生物防制和传染病监测等，特别强调安置点内的厕所卫生、污水处置、安置人员饮食卫生以及对外来人员开展新冠肺炎疫情防控等问题的处置进行指导，并向安置点提供了灾后卫生防疫相关宣传健康教育材料。
医疗防疫组对灾区灾后疫情防控工作提出三个加强的工作建议，即加强灾后灾区的传染病监测、症状检测和病例报告，及时发现聚集性疫情；加强灾后健康教育的宣传，结合疫情防控和地震灾害开展宣传；加强新冠肺炎疫苗接种工作。
